ผู้ประกอบการจดทะเบียนมีหน้าที่เก็บและรักษารายงานเกี่ยวกับภาษีมูลค่าเพิ่ม โดยต้องปฏิบัติตามหลักเกณฑ์ และระยะเวลาที่สรรพากรกำหนด

ผู้ประกอบการจดทะเบียนภาษีมูลค่าเพิ่มมีหน้าที่ต้องยื่นแบบ ภ.พ.30 และนำส่งภาษีมูลค่าเพิ่ม หากยื่นแบบล่าช้าก็จะต้องเสียเบี้ยปรับและเงินเพิ่ม

การฝากขายสินค้ากับตัวแทน เช่น ห้างสรรพสินค้า ร้านค้าต่างๆ ซึ่งมีหน้าที่ขายสินค้าแทนผู้ฝากสินค้า จะต้องรับรู้รายได้และภาษีมูลค่าเพิ่มเมื่อใด